Органи Фонда за науку су: директор, Надзорни одбор, Управни одбор и Научни савет Фонда за науку.
Директор
Проф. др Ненад Филиповић
Управни одбор
Михаило Весовић
Председник УО
Привредна комора Србије – Сектор за стратешке анализе, услуге и интернационализацију
директор
др Весна Дамњановић
Заменик УО
Факултет организационих наука, Универзитет у Београду
професор
др Владан Вулетић
Члан УО
Масачусетски технолошки институт (МИТ, САД)
професор
др Јован Бабић
Члан УО
Филозофски факултет, Универзитет у Београду
професор
др Вук Радојевић
Члан УО
Институт за ратарство и повртарство Нови Сад
доцент
Надзорни одбор
Проф. др Милорад Филиповић, Универзитет у Београду – Економски факултет
Проф. др Марија Игњатовић, Универзитет у Нишу – Правни факултет
Научни савет
Др Мирослав Николић, Институт за мултидисциплинарна истраживања, Универзитет у Београду
Проф. др Милан Пантић, Природно-математички факултет, Универзитет у Новом Саду
Проф. др Ђорђе Вукелић, Факултет техничких наука, Универзитет у Новом Саду
Др Душан Старчевић, професор емеритус, Факултет организационих наука, Универзитет у Београду
Проф. др. Владимир Ђукић, Медицински факултет, Универзитет у Београду
Проф. др Снежана Пајовић, Медицински факултет, Универзитет у Нишу
Проф. др Снежана Богосављевић Бошковић, Агрономски факултет у Чачку, Универзитет у Крагујевцу
Проф. др Александар Фиштеш, Технолошки факултет, Универзитет у Новом Саду
Др Мина Зиројевић, Институт за упоредно право у Београду
Проф. др Милан Јовановић, Факултет политичких наука, Универзитет у Београду
Проф. др Љиљана Рогач Мијатовић, Факултет драмских уметности, Универзитет уметности у Београду
Проф. др Александар Растовић, Историјски институт у Београду
Игор Богићевић, Seven Bridges Genomics д.о.о Београд
Др. Дарко Ивановић, 2Д Софт